忍冬ICE1基因的cDNA克隆及表达分析

乔永刚, 贾孟君, 陈亮, 崔芬芬, 王勇飞, 曹亚萍, 王文斌, 宋芸*
山西农业大学生命科学学院, 山西太谷030801

通信作者:宋芸;E-mail: songyun0283@126.com

摘 要:

采用RT-PCR技术克隆得到忍冬(Lonicera japonica) ICE1 (inducer of CBF expression 1)基因LjICE1 (GenBank: MK584895), 其cDNA序列全长为1 575 bp, 编码524个氨基酸, 理论等电点5.58, 为不稳定亲水性蛋白, 含多个糖基化和磷酸化位点, 且具有类似MYC元件的bHLH结构。同源比对发现ICE1蛋白含有富S区、 NLS区、bHLH结构域、 Zipper结构域和跨膜区, 系统进化分析发现LjICE1与茶树(Camellia sinensis)的亲缘关系最近。RT-qPCR结果表明, LjICE1基因在低温胁迫3 h时表达量最高。本研究为进一步解析忍冬低温响应机制提供了基因资源。

关键词:忍冬; ICE1; 基因克隆; 生物信息学; 基因表达

收稿:2019-07-09   修定:2019-09-23

资助:山西省科技攻关项目(20140312001-2)、山西省高等学校教学改革创新项目(J2017031)和山西省基础研究计划(201801D121204)。

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